Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLTPP55058 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLTPP55058 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLTPP55058 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLTPP55058 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLTPP55058 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLTPP55058 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLTPP55058 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PLTPP55058 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLTPP55058 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLTPP55058 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms