Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSR4P51571 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR4P51571 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR4P51571 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR4P51571 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR4P51571 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms