Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CRIP1P50238 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms