Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FDFT1P37268 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FDFT1P37268 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms