Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms