Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms