Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms