Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB2P26583 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms