Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTAFRP25105 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms