Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VAMP1P23763 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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