Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRZ1P23471 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms