Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD247P20963 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD247P20963 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD247P20963 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms