Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCNA2P20248 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms