Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS1P17812 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms