Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HOXB9P17482 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms