Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG2P13727 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRG2P13727 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRG2P13727 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRG2P13727 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG2P13727 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms