Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ODC1P11926 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODC1P11926 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODC1P11926 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODC1P11926 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms