Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHGAP10645 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHGAP10645 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHGAP10645 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHGAP10645 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHGAP10645 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHGAP10645 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms