Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLK3P07288 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLK3P07288 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLK3P07288 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLK3P07288 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLK3P07288 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLK3P07288 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLK3P07288 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLK3P07288 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLK3P07288 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLK3P07288 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLK3P07288 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLK3P07288 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLK3P07288 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLK3P07288 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLK3P07288 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLK3P07288 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLK3P07288 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLK3P07288 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLK3P07288 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLK3P07288 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLK3P07288 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLK3P07288 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLK3P07288 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms