Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
THY1P04216 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
THY1P04216 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THY1P04216 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THY1P04216 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms