Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN3BO60391 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN3BO60391 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN3BO60391 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN3BO60391 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN3BO60391 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN3BO60391 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN3BO60391 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN3BO60391 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRIN3BO60391 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN3BO60391 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms