Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR3O43761 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms