Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC7A4O43246 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms