Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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