Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSMD9O00233 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms