Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms