Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2J1Q9Y385 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms