Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms