Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHF8Q9UPP1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms