Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCNL1Q9UK58 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNL1Q9UK58 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms