Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1Q9UJ41 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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