Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5BQ9UGL1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms