Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNAL1Q9UBT7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms