Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPASTQ9UBP0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms