Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRBP1Q9P2E9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRBP1Q9P2E9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms