Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCC2Q9P258 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms