Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC88CQ9P219 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms