Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAPAQ9P0L0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms