Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms