Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT57Q9NWB7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT57Q9NWB7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms