Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RRP7BPQ9NSQ0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms