Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMSN1Q9NSI8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMSN1Q9NSI8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMSN1Q9NSI8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMSN1Q9NSI8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMSN1Q9NSI8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMSN1Q9NSI8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMSN1Q9NSI8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMSN1Q9NSI8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMSN1Q9NSI8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMSN1Q9NSI8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMSN1Q9NSI8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMSN1Q9NSI8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMSN1Q9NSI8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMSN1Q9NSI8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMSN1Q9NSI8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms