Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F12Q9HCS2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F12Q9HCS2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms