Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KIAA1549Q9HCM3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KIAA1549Q9HCM3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms