Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms