Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMBRA1Q9C0C7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms