Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTNAP4Q9C0A0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms