Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTRT3Q9BYD9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms