Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLDIP3Q9BY77 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms