Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NICN1Q9BSH3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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